Музей создан в 1987 году как Музей комсомольской слваы, где хранились соответствующие атрибуты: значки, вымпелы, комсомольские билеты и другие предметы.  В 1992 году музей был переорганизован в музей переселения колхозов Чурапчинского района в 1942-1944 годах, где и по сей день хранятся документы о переселении и личные вещи участников переселения.

     В связи с тяжелым продовольственным положением в стране и на фронте ЦК ВКП (б) и СМ СССР вынесли в 1942 году постановление "О развитии рыбных промыслов в бассейнах рек Сибири и Дальнего Востока".  В это время в группе центральных и вилюйских районов Якутии стояла сильная засуха. Ко всем бедам сельского населения республики прибавились тяготы и страдания, связанные с Великой Отечественной войной. Высшее партийное руководство Якутской АССР приняло решение в принудительном порядке переселить колхозников Чурапчинского района для рыбодобычи в северные районы республики. Таким образом, из Чурапчинского района был переселен 41 колхоз в Жиганский, Булунский  и Кобяйский районы. На родину люди смогли вернуться лишь в 1944 году.

     В настоящее время музей активно развивается и участвует в культурной жизни улуса, являясь хранителем памяти жителей района о переселении. Сотрудники музея проводят школьные часы, многочисленные встречи и круглые столы с жителями и гостями улуса.